Données pour Module BioInformatique : TP Transcriptomics

 

Injection de LPS (homme) : données de Calvano et al, Nature 2005

Données normalisées par GCRMA et filtrées (pour enlever tous probe-sets ou le probe-set en question n’est pas exprimé dans tous les conditions) ; plus annotation Affymetrix (WR, IGBMC) :

  4 (ou) 3 répliquas pour chaque injection LPS ou placebo apres 0, 2, 4, 6, 8, 9, et 24h   (ou 0, 2 et 4h)

En format pour cluspack :

  filtré, tous conditions : calvano.gcrma.red1Ann.txt

filtré et standardisé (tous conditions) : calvano.gcrma.redStd1Ann.txt

 

  filtré, conditions 0, 2h , 4h : calvano.gcrma.red2Ann.txt

filtré et standardisé (0, 2, 4h) : calvano.gcrma.redStd2Ann.txt

 

 

Données de cycle cellulaire de levure

yeast3000.orig

 

 

Données des cellules de leucémie traité avec l’acide rétinoique

Leukem_RA3.txt , Leukem_RA4.txt, Leukem_RA5.txt

 

 

 

              dernière mise à jour WR, 12/6/06